El ICM se dedica a estudiar, de forma integrada, el medio marino y los organismos que en él habitan, con voluntad pluridisciplinar. La larga experiencia del Instituto y su equipo humano, formado por más de 150 personas especialistas en distintos aspectos de la investigación oceanográfica (física, química, geología y biología), conlleva una visión global del ecosistema marino, así como capacidad para valorar el impacto humano sobre este medio y buscar soluciones al respecto. El objetivo principal de las actividades desarrolladas en el centro es la investigación multidisciplinar del mar, a través de proyectos de investigación que estudian diversos aspectos del ecosistema y del medio marino.